Muy pronto

MetGraph

La plataforma para analizar datos metabolómicos sin escribir una sola línea de código. Desde la construcción de librerías hasta el análisis estadístico avanzado — todo con clics.

Anotación con Sirius & MetFrag Redes moleculares GNPS Clasificación química PCA · t-SNE · ASCA Sin código
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El proyecto

¿De qué trata MetGraph?

MetGraph nace para resolver un problema muy concreto: analizar datos de metabolómica hoy exige programar, encadenar herramientas dispersas y entender flujos de bioinformática complejos. Eso deja fuera a muchos investigadores que entienden su ciencia perfectamente, pero no tienen por qué saber programar para aprovecharla.

Por eso estamos construyendo una plataforma 100% basada en clics, pensada para usuarios principiantes: desde subir tu tabla de features y metadatos, hasta construir librerías de estructuras, anotar tus compuestos, visualizar redes moleculares y correr análisis estadísticos y longitudinales — sin tocar una terminal.

Qué vas a poder hacer

Todo tu flujo de metabolómica, en un solo lugar

📁

Datasets & librerías

Administra tus feature tables, metadata y anotaciones, junto con tus propias librerías de estructuras.

🧬

Construcción de librerías

Busca estructuras por especie en KEGG, BiGG, BioCyc, NPAtlas, LOTUS, ChEBI, Metabolomics Workbench y MetaboLights.

🔎

Anotación

Conecta con Sirius, MetFrag y MoNA, o busca por similitud de m/z directamente en la plataforma.

🧩

Enriquecimiento de anotaciones

Enriquece tus resultados con PubChem, RDKit, ClassyFire y NPClassifier.

🛠️

Corrección de anotaciones

Predicción de tiempo de retención y revisión de aductos para encontrar análogos.

🌐

Redes & clasificación química

Molecular networking con GNPS y GraphML, similitud de Tanimoto, dendrogramas, Chemical Pie, Sunburst y Tree.

📊

Procesamiento & estadística

Filtrado, imputación, normalización, transformación y escalamiento, con pruebas estadísticas como Shapiro y Levene.

🧭

Similitud de metabolomas

UpSet plots, PCA, PCoA y t-SNE para comparar tus muestras y datasets.

⏱️

Análisis longitudinal

ASCA, Friedman, MEBA y Cosinor para estudiar cambios metabólicos a lo largo del tiempo.

🎯

Análisis de enriquecimiento

ChemRICH, ORA, MSEA y Mummichog para encontrar las vías metabólicas relevantes.

En colaboración con